Bezüglich der umweltgerechten und ressourcenschonenden Rückführung des Abwassers innerhalb des Fischereihafens betreibt die FBG ein Abwassernetz, welches an die Zentralkläranlage (ZKA) angeschlossen ist. Das Netz ist jeweils mit einem Schmutz- und Regenwasserkanal ausgestattet.